【思路】
题干矛盾:尽管鸭蛋的市场价格比鸡蛋便宜,但为使职工所摄入的蛋白质数量不低于食用鸡蛋的蛋白质摄入量,该食堂需要支付比鸡蛋更多的钱来购买鸭蛋。
A项:每千克鸭蛋的蛋白质含量低于鸡蛋,解释了题干矛盾,保留。
B项:市场上鸭蛋也存在供应不足的现象,与题干矛盾无关,排除。
C项:单位将拿出更多的钱来补贴食堂,与题干矛盾无关,排除。
D项:单位食堂的财务管理存在问题,与题干矛盾无关,排除。
因此,答案为A。