【思路】
第二空,横线处后边“一定程度一定程度导致了科研成果市场化程度低、技术成果社会转换利用率不高的问题。”,所以产研是分开的。A项分离、D项脱节符合语境,保留。C项共建和B项互促与文意相悖,排除。
第一空,根据横线处后边,“多数军工院所依然在事业单位体制内,独立于市场经济之外”,可知军工集团改制并不彻底。A项彻底符合语境,当选。D项全面不符合语境,排除。
因此,答案为A。