【思路】
根据文段“霍乱有三种传播方式:人与人之间的接触传播、从人到食物(被污染)再到人、通过污染的水源进行传播。其中第三种传播方式,病菌不依赖于健康的宿主进行传播”可知,霍乱通过水源更容易传播,且根据“三个国家中,智利有良好的水源供应,厄瓜多尔是整个南美洲水源保护最差的地方,而秘鲁的水源供应保护水平处于两者之间。”可知,“厄瓜多尔”应该是霍乱中病毒性进化最强的国家,对应B项。
因此,答案为B。